تُعد مراكز التميز البحثي إحدى الثمار التطويرية لوزارة التعليم العالي التي تبنتها ضمن حزمة من البرامج التي تهدف إلى رفع كفاءة التعليم في المملكة العربية السعودية. ولكون تطوير العلوم والرياضيات من القضايا التي تتصدر اهتمام برامج الإصلاح والتطوير التربوي في المملكة، صدرت موافقة وزارة التعليم العالي على تمويل مركز التميز البحثي في تطوير تعليم العلوم والرياضيات، وذلك ضمن المرحلة الثانية من مشروع مراكز التميز البحثي. وقد وقّع معالي وزير التعليم العالي الأستاذ الدكتور خالد بن محمد العنقري عقد تمويل المركز مع معالي مدير الجامعة الأستاذ الدكتور عبدالله العثمان.